Является центром интеграции ботанических и экологических исследований в Сибири, осуществляющим комплексные исследования всех компонентов растительного мира – сосудистых растений, водорослей, лишайников и грибов.
В ЦСБС СО РАН сформированы крупнейшие в Азиатской России коллекции и экспозиции растений, в которых представлено более 14000 таксонов (видов, форм, гибридов, культиваров) - «Парк Бонсай», «Вальс цветов», «Вересковый сад», «Дендрарий», «Регулярный французский сад», «Сад непрерывного цветения», «Сад топиарного искусства», «Лекарственные и пряно-ароматические растения», «Кактусы и другие суккуленты Старого и Нового света», «Растения тропических и субтропических областей Земного шара».